More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1297 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  70.73 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  70.43 
 
 		 120 aa  178  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  67.48 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  68.7 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  64.75 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  64.35 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  61.67 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  62.3 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  71.07 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  62.18 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  63.41 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  61.42 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  55.47 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  65.49 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  66.09 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  66.07 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  56.2 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  60.83 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  59.68 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  64.35 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  63.03 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  59.68 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  59.68 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  61.21 
 
 		 117 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  63.33 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  57.36 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  57.36 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  54.62 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  61.06 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  58.27 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  56.69 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  64.22 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  57.14 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  55.65 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  57.98 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  58.82 
 
 		 137 aa  153  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  58.97 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  53.54 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  56.8 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  57.85 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  59.13 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  54.4 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  55.65 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  53.6 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  63.3 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  57.14 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  55.65 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  55.65 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  53.78 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  52.17 
 
 		 123 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  61.34 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  56.48 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  46.34 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  62.39 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  57.98 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  57.98 
 
 		 121 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  61.47 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  57.98 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  41.96 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  41.96 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  53.21 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  41.53 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  51.96 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  52.38 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  53.4 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.98 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  52.43 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  52.43 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  50.48 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  40.18 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  52.43 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  44.23 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  47.57 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  50.96 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  45.45 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  51.49 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  51.49 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  51.04 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  41.03 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  48.39 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  47.52 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  46.46 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  44.44 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  48.51 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  46.88 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  42.16 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  47.06 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  47.87 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  46.32 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  37.5 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  47.47 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  46.81 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  41.58 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  46.53 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  44.79 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  53.33 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  42 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>