23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1154 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  259  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  47.46 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  46.28 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  43.59 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  46.28 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  46.28 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  46.28 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  41.53 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  42.24 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  44.63 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  45.26 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  44.35 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  39.64 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  41.88 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  38.61 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4130  hypothetical protein  44.74 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  38.83 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  36.89 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2859  hypothetical protein  44.07 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12130  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.949381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  44.05 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1064  integral membrane protein  33.07 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.111624  normal  0.666694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>