207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1141 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  100 
 
 		 67 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  57  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  47.27 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  53.7 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  57.78 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  57.78 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  38.6 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  42.62 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  41.27 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  42.59 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  42.37 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  43.1 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  40 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3891  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000029695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  38.98 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>