More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1138 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  350  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  75.28 
 
 
178 aa  271  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  75.84 
 
 
178 aa  270  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  74.72 
 
 
178 aa  266  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  70.79 
 
 
178 aa  265  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  71.91 
 
 
178 aa  262  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  72.22 
 
 
179 aa  262  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  70.39 
 
 
180 aa  261  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  71.91 
 
 
178 aa  260  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  73.33 
 
 
179 aa  259  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  70.39 
 
 
179 aa  257  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  73.74 
 
 
179 aa  257  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  70.95 
 
 
179 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  71.67 
 
 
179 aa  255  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  73.18 
 
 
179 aa  255  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  72.78 
 
 
180 aa  255  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  71.67 
 
 
179 aa  254  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  70.56 
 
 
179 aa  250  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  72.38 
 
 
180 aa  249  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  69.83 
 
 
179 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  69.1 
 
 
177 aa  249  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 
179 aa  248  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 
179 aa  246  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  68.16 
 
 
180 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  67.04 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  67.78 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  66.48 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  66.3 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  65.17 
 
 
178 aa  228  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  61.8 
 
 
178 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  62.92 
 
 
181 aa  221  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  63.24 
 
 
185 aa  220  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  60.67 
 
 
179 aa  216  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  64 
 
 
177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  203  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 
179 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 
179 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  200  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  200  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  54.8 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.93 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  55.11 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  197  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.93 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 
179 aa  193  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.37 
 
 
180 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  56.47 
 
 
182 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  54.44 
 
 
184 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
182 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
180 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  54.05 
 
 
187 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  56.14 
 
 
182 aa  191  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  55.23 
 
 
183 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  191  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 
182 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  190  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  190  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  52.54 
 
 
181 aa  190  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  56.18 
 
 
178 aa  189  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  54.24 
 
 
177 aa  189  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 
183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  54.21 
 
 
191 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  55.37 
 
 
177 aa  187  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 
178 aa  187  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  187  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  187  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 
178 aa  187  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  186  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 
181 aa  185  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
179 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  53.71 
 
 
177 aa  184  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  51.98 
 
 
179 aa  184  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  184  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 
187 aa  184  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 
179 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  53.59 
 
 
185 aa  183  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  56.28 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  55.23 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>