More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1076 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  66.6 
 
 
523 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  70.33 
 
 
519 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
518 aa  1030    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  65.19 
 
 
518 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.39 
 
 
517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.2 
 
 
538 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.05 
 
 
510 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.47 
 
 
528 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.78 
 
 
510 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.09 
 
 
509 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  58.3 
 
 
513 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.47 
 
 
510 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  53.67 
 
 
510 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.67 
 
 
510 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.67 
 
 
510 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.67 
 
 
510 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.67 
 
 
510 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  53.47 
 
 
510 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.74 
 
 
509 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.56 
 
 
508 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.25 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.25 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.25 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.7 
 
 
509 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.7 
 
 
509 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.7 
 
 
509 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.7 
 
 
509 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.17 
 
 
494 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.69 
 
 
510 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.17 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.17 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.17 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.17 
 
 
508 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.74 
 
 
508 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.79 
 
 
508 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.21 
 
 
508 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.81 
 
 
515 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.26 
 
 
511 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.83 
 
 
512 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.21 
 
 
508 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.22 
 
 
508 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  55.07 
 
 
511 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.79 
 
 
509 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.87 
 
 
509 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.74 
 
 
518 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.32 
 
 
514 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.28 
 
 
509 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.58 
 
 
509 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  53.15 
 
 
508 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  50.76 
 
 
518 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.76 
 
 
518 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.7 
 
 
508 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.34 
 
 
518 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.75 
 
 
514 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.57 
 
 
512 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.49 
 
 
508 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.68 
 
 
508 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.43 
 
 
518 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.12 
 
 
509 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.05 
 
 
522 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.9 
 
 
509 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.93 
 
 
509 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.05 
 
 
538 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.24 
 
 
523 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.43 
 
 
523 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.04 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.66 
 
 
523 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.38 
 
 
520 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.28 
 
 
524 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.57 
 
 
523 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.33 
 
 
524 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.04 
 
 
517 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.96 
 
 
514 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.24 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.65 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.38 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.91 
 
 
529 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.51 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.7 
 
 
543 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.29 
 
 
549 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.19 
 
 
530 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.21 
 
 
532 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  38.19 
 
 
1128 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  42.07 
 
 
1060 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  37.34 
 
 
533 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.77 
 
 
376 aa  289  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3430  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  45.31 
 
 
385 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4705  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.11 
 
 
380 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3538  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.43 
 
 
380 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0973  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  43.6 
 
 
429 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0913  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  43.6 
 
 
476 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2559  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.6 
 
 
379 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2969  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.6 
 
 
379 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2157  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.74 
 
 
380 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1435  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.2 
 
 
374 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.04 
 
 
372 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2183  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.18 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1384  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.17 
 
 
440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3968  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.74 
 
 
375 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52416  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.16 
 
 
373 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>