More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1046 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  82.12 
 
 
274 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  83.21 
 
 
274 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  81.39 
 
 
274 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  81.39 
 
 
274 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  77.21 
 
 
274 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  75.72 
 
 
276 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  75.46 
 
 
274 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  73.55 
 
 
276 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  70.44 
 
 
274 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  73.19 
 
 
276 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  74.64 
 
 
276 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  73.19 
 
 
276 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  73.55 
 
 
276 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  73.19 
 
 
276 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  73.09 
 
 
276 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  70.33 
 
 
274 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  69.34 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  71.27 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  72.73 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  70.55 
 
 
276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 
276 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  65.19 
 
 
276 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  66.19 
 
 
278 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  64.39 
 
 
395 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  65.7 
 
 
278 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 
330 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  65.09 
 
 
338 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  65.93 
 
 
276 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  66.06 
 
 
278 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  65.33 
 
 
274 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  63.04 
 
 
276 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  64.62 
 
 
278 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  64.62 
 
 
278 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  64.62 
 
 
278 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  64.03 
 
 
278 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  64.1 
 
 
343 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  64.73 
 
 
280 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  63.54 
 
 
278 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  64 
 
 
280 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  62.91 
 
 
342 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  63.3 
 
 
272 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  62.77 
 
 
273 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  62.77 
 
 
280 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  62.23 
 
 
278 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  63.31 
 
 
278 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  64.98 
 
 
278 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  63.9 
 
 
278 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  63.31 
 
 
278 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  61.96 
 
 
277 aa  360  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  60.79 
 
 
278 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  60.79 
 
 
278 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  60.79 
 
 
278 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  60.44 
 
 
271 aa  357  9e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  60.51 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  59.85 
 
 
273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  59.12 
 
 
273 aa  348  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  59.12 
 
 
273 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  58.76 
 
 
273 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  55.88 
 
 
273 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  58.39 
 
 
273 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  56.93 
 
 
274 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 
276 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  57.66 
 
 
273 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  61.51 
 
 
278 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  54.61 
 
 
330 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  57.66 
 
 
273 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  56.57 
 
 
273 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  55.84 
 
 
273 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  56.57 
 
 
273 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 
317 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  56.2 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  56.3 
 
 
324 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  55.84 
 
 
324 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 
273 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  54.01 
 
 
274 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 
290 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  56.04 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  55.43 
 
 
276 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  56.78 
 
 
273 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  54.74 
 
 
277 aa  318  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  54.24 
 
 
274 aa  318  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  56.93 
 
 
273 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  54.24 
 
 
322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  51.09 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  52.94 
 
 
274 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  53.33 
 
 
334 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  52.57 
 
 
322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  56.2 
 
 
273 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  56.2 
 
 
273 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  54.38 
 
 
326 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  56.2 
 
 
273 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  54.38 
 
 
326 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  54.01 
 
 
326 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
338 aa  291  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 
328 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>