More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1020 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 646 aa  1245    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  41.69 
 
 		 680 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  39.8 
 
 		 671 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  40.7 
 
 		 689 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  40.07 
 
 		 698 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  39.12 
 
 		 682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  36.63 
 
 		 788 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  31.04 
 
 		 787 aa  258  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  36.01 
 
 		 639 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  36.42 
 
 		 687 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  34.96 
 
 		 743 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 		 657 aa  246  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  28.25 
 
 		 744 aa  238  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  43.46 
 
 		 665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.45 
 
 		 656 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  33.71 
 
 		 653 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  29.89 
 
 		 656 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  46.31 
 
 		 634 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  49.6 
 
 		 652 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  43.06 
 
 		 1085 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 		 697 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  43.84 
 
 		 662 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.35 
 
 		 749 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  44 
 
 		 450 aa  190  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 		 1193 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  46.61 
 
 		 725 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  35.13 
 
 		 432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  45.34 
 
 		 444 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  45.89 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  46.29 
 
 		 448 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  44.44 
 
 		 697 aa  183  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  44.75 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  47.27 
 
 		 450 aa  181  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.32 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  37.67 
 
 		 622 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  41.87 
 
 		 678 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  44.49 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  38.58 
 
 		 466 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  36.4 
 
 		 434 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 450 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.04 
 
 		 441 aa  170  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  38.24 
 
 		 478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.75 
 
 		 299 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  48.39 
 
 		 134 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  39.67 
 
 		 387 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  35.08 
 
 		 617 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.84 
 
 		 305 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  39.71 
 
 		 352 aa  110  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  28.74 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  26.54 
 
 		 570 aa  104  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  26.15 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  26.15 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  28.86 
 
 		 569 aa  103  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  28.51 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  30.74 
 
 		 577 aa  100  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 		 443 aa  97.4  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  35.95 
 
 		 775 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  28.84 
 
 		 772 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.81 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.17 
 
 		 580 aa  94.7  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  31.93 
 
 		 228 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.71 
 
 		 468 aa  94.4  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  38.03 
 
 		 771 aa  94  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 425 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  33.92 
 
 		 405 aa  92  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.45 
 
 		 451 aa  91.7  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  32.98 
 
 		 789 aa  91.3  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  29.13 
 
 		 308 aa  90.9  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  34.71 
 
 		 773 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  34.12 
 
 		 773 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  34.72 
 
 		 416 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.79 
 
 		 739 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  32.98 
 
 		 393 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  37.24 
 
 		 771 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  30.94 
 
 		 400 aa  87.4  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.22 
 
 		 746 aa  87  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  29.37 
 
 		 459 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  38.52 
 
 		 766 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  32.34 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  31.51 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.07 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  29.7 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.43 
 
 		 703 aa  84.7  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  29.81 
 
 		 795 aa  84.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  34.64 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  34.03 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  31.15 
 
 		 443 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.71 
 
 		 493 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  30.5 
 
 		 328 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  30.51 
 
 		 367 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.16 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  33.74 
 
 		 711 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  35.6 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 776 aa  82  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.41 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.47 
 
 		 754 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  35.59 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.79 
 
 		 701 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>