More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0929 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 346 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.18 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.13 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  48.13 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  49.84 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  46.76 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  48.45 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  47.45 
 
 		 334 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  47.45 
 
 		 334 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  48.26 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  47.45 
 
 		 334 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  48.26 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  48.26 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  45.59 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.48 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  42.79 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  49.65 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  48.98 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.71 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  48.38 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  41.72 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.83 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.74 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.58 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  40.99 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  40.75 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4515  cytochrome c assembly protein  40.4 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  38.35 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8079  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.38 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0986266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.83 
 
 		 358 aa  205  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.795122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4095  cytochrome c assembly protein  39.36 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16923  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  38.59 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  36.77 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.57 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  38.87 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  38.87 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  38.87 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.38 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.36 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.51 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  38.78 
 
 		 276 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.53 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.37 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17940  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  40.08 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0524  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.71 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  37.22 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.26 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  36.74 
 
 		 271 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  37.15 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.74 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.1 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.13 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2731  cytochrome c assembly protein  35.94 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  normal  0.099851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.52 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.29 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  33.43 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  33.46 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  35.93 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.21 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  34.43 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2075  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.02 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.19 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.56 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  34.94 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  35.63 
 
 		 284 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.24 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.24 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  35.98 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  35.15 
 
 		 284 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.32 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  33.7 
 
 		 278 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.69 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.02 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  35.53 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  33.69 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.17 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  35.17 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.6 
 
 		 282 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  35.17 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.17 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  35.17 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.4 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.1 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  34.78 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.95 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.51 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.42 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  34.48 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  37.25 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  34.83 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.29 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  34.81 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  34.83 
 
 		 408 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  34.83 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  33.77 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  34.83 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  34.83 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>