More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0894 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  57.5 
 
 		 262 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  44.37 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  46.06 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  52 
 
 		 876 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  50.34 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  46.33 
 
 		 616 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  49.07 
 
 		 652 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  48.45 
 
 		 652 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  41.57 
 
 		 624 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  45.58 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  44.31 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  52.26 
 
 		 629 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 		 348 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  42.47 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 		 349 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  38.04 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  45.59 
 
 		 307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  43.12 
 
 		 671 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  43.12 
 
 		 671 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 354 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  45.45 
 
 		 600 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  41.25 
 
 		 617 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  41.14 
 
 		 671 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 311 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 311 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  37.18 
 
 		 335 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  40.61 
 
 		 617 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 		 265 aa  101  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  46.27 
 
 		 311 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  39.38 
 
 		 613 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  39.38 
 
 		 613 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  39.38 
 
 		 613 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 630 aa  97.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 		 249 aa  97.8  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  39.01 
 
 		 664 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  38.26 
 
 		 553 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 248 aa  94.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  44.59 
 
 		 155 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 288 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 339 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  37.97 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 281 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  32.3 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 		 241 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  39.16 
 
 		 235 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.67 
 
 		 270 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 262 aa  87.8  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  36.31 
 
 		 624 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 		 336 aa  85.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  41.96 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.8 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  41.56 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  43.06 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  38.31 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  39.16 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  36.59 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.44 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  35.37 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  37.66 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  31.85 
 
 		 644 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  36.05 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  38.03 
 
 		 174 aa  72  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>