74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0863 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 
362 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  64.97 
 
 
361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  65.52 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  66.67 
 
 
391 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  66.67 
 
 
391 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  64.66 
 
 
359 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  64.37 
 
 
359 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  62.5 
 
 
373 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  62.64 
 
 
361 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  64.37 
 
 
394 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  62.64 
 
 
362 aa  418  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  63.13 
 
 
368 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  61.03 
 
 
371 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  61.03 
 
 
371 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  61.03 
 
 
371 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  65.23 
 
 
358 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  61.43 
 
 
373 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  61.45 
 
 
359 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  61.89 
 
 
358 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  61.47 
 
 
362 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  63.51 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  63.9 
 
 
361 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  60.63 
 
 
360 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  57.46 
 
 
358 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  59.89 
 
 
359 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  59.83 
 
 
359 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  57.71 
 
 
361 aa  381  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  56.9 
 
 
358 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  56.98 
 
 
360 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  47.69 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  44.77 
 
 
360 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  44.83 
 
 
359 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  43.19 
 
 
361 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  44.09 
 
 
363 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  43.54 
 
 
359 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  43.97 
 
 
354 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  43.6 
 
 
361 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  43.61 
 
 
358 aa  285  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  45.45 
 
 
359 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  41.34 
 
 
357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  42.94 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  41.5 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  41.34 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  41.34 
 
 
357 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
357 aa  281  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  39.02 
 
 
356 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  37.57 
 
 
351 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  39.05 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  40.9 
 
 
361 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  41.89 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  41.07 
 
 
352 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  35.88 
 
 
362 aa  226  6e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  40.36 
 
 
357 aa  223  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  33.04 
 
 
354 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  36.36 
 
 
359 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  29.67 
 
 
349 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  30.27 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  39.34 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  35.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  36.54 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  30.65 
 
 
749 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  38.78 
 
 
51 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 
604 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  22.45 
 
 
749 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  32.35 
 
 
833 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  27.42 
 
 
751 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  43.1  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>