More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0859 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  100 
 
 		 334 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  99.7 
 
 		 334 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  100 
 
 		 334 aa  673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  50.91 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  50.61 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  48.61 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  49.54 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  47.2 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  46.04 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  46.58 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  48.17 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  45.76 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  45.76 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  45.76 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  45.76 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  45.76 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  48.79 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  48.79 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  48.17 
 
 		 385 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  47.26 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  45.76 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 479 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3555  Integrase catalytic region  46.6 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  44.72 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  45.51 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  45.51 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  45.51 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  45.96 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  47.09 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  47.09 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  45.15 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.98 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  41.64 
 
 		 453 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  44.55 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  46.83 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  44.98 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  45.65 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  44.38 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  44.17 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  45.4 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  44.74 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  44.14 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  44.89 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  44.41 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  42.56 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  42.56 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  40.37 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 465 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 465 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  41.21 
 
 		 480 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  41.21 
 
 		 480 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  40.11 
 
 		 465 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  49.66 
 
 		 421 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  45.4 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  46.74 
 
 		 370 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>