215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0834 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  100 
 
 
390 aa  782    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  60.22 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  56.58 
 
 
394 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  55.81 
 
 
433 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  54.1 
 
 
388 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  54.78 
 
 
402 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  51.28 
 
 
419 aa  358  6e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  46.61 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  45.66 
 
 
420 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  40.25 
 
 
433 aa  252  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  41.97 
 
 
415 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  40.36 
 
 
399 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  42.11 
 
 
444 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  36.62 
 
 
399 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  42.39 
 
 
444 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  39.27 
 
 
429 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  34.14 
 
 
381 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  38.53 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  35.81 
 
 
333 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  38.79 
 
 
412 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.65 
 
 
307 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  31.91 
 
 
311 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  38.14 
 
 
412 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  38.92 
 
 
418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30.75 
 
 
439 aa  172  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.22 
 
 
338 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  31.54 
 
 
419 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.93 
 
 
311 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.7 
 
 
312 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  27.72 
 
 
315 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  32.76 
 
 
405 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  31.54 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.47 
 
 
315 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.72 
 
 
350 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  25 
 
 
328 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  28.65 
 
 
409 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.1 
 
 
602 aa  143  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.8 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.04 
 
 
326 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  30.5 
 
 
449 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  33.02 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  29.07 
 
 
412 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.8 
 
 
359 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.08 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.87 
 
 
345 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  27.97 
 
 
307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30.2 
 
 
360 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  24.78 
 
 
320 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.82 
 
 
320 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.93 
 
 
332 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  28.81 
 
 
315 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  27.78 
 
 
464 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  28.44 
 
 
462 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.66 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  26.65 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  32.64 
 
 
337 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  28.04 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.84 
 
 
311 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  26.65 
 
 
448 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  26.65 
 
 
448 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  25 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.58 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  26.58 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.94 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.15 
 
 
323 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  25.95 
 
 
323 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  27.53 
 
 
355 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  24.71 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  27.53 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  27.86 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  23.96 
 
 
307 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.46 
 
 
342 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  27.1 
 
 
423 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  22.42 
 
 
348 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  25 
 
 
323 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  30.16 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  25.51 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  30.16 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  26.54 
 
 
472 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  26.23 
 
 
448 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  30.16 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  29.76 
 
 
307 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  24.34 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  24.34 
 
 
307 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25.41 
 
 
328 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.13 
 
 
388 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  24.2 
 
 
307 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  24.09 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.38 
 
 
323 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.38 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.38 
 
 
323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  25.68 
 
 
325 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  24.77 
 
 
323 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.38 
 
 
323 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  29.76 
 
 
307 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.59 
 
 
354 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.44 
 
 
342 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.65 
 
 
346 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>