281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0809 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  100 
 
 
625 aa  1236    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  32.98 
 
 
436 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  33.04 
 
 
466 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  33.04 
 
 
466 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.95 
 
 
947 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  31.38 
 
 
465 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  33.33 
 
 
466 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  32.59 
 
 
466 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  33.33 
 
 
466 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  34.21 
 
 
466 aa  90.5  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  34.21 
 
 
466 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  34.21 
 
 
466 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  34.21 
 
 
466 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.5 
 
 
584 aa  90.5  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  35.64 
 
 
466 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.93 
 
 
518 aa  87.4  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32 
 
 
502 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  33.81 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  33.19 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  32.75 
 
 
519 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  32.03 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  37.5 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  35.38 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  28.17 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  31.34 
 
 
312 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.09 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.74 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.88 
 
 
391 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  32.95 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.2 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  35.03 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  36.84 
 
 
1131 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  26.67 
 
 
677 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.86 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  32.07 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.41 
 
 
553 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.57 
 
 
775 aa  73.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.46 
 
 
674 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  30.48 
 
 
548 aa  72.4  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  36.13 
 
 
536 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.46 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.57 
 
 
1077 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  34.97 
 
 
1103 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.33 
 
 
339 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  30.6 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  36.13 
 
 
535 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  28.29 
 
 
455 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  39.45 
 
 
514 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  31.98 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  41.73 
 
 
502 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  28.42 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  26.99 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  25.94 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  28.85 
 
 
1147 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  35.26 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  33.95 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  30.63 
 
 
523 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  33 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  30.41 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  34.57 
 
 
558 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  35.52 
 
 
556 aa  67  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  31.22 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.59 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  31.82 
 
 
647 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  42.39 
 
 
512 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  33.85 
 
 
558 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  35.51 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  33.85 
 
 
558 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.18 
 
 
309 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  26.63 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.95 
 
 
546 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.78 
 
 
598 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  31.41 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  31.52 
 
 
479 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  23.13 
 
 
390 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.9 
 
 
552 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  25.53 
 
 
450 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  31.52 
 
 
479 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  31.52 
 
 
479 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  32.77 
 
 
569 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  31.63 
 
 
468 aa  64.7  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.69 
 
 
282 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.21 
 
 
334 aa  64.3  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  32.51 
 
 
534 aa  63.9  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  32.77 
 
 
629 aa  63.9  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.24 
 
 
557 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  31.6 
 
 
439 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.24 
 
 
557 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.24 
 
 
557 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.08 
 
 
330 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35493  predicted protein  30.92 
 
 
450 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  34.57 
 
 
557 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  33.63 
 
 
503 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  30.48 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  30.14 
 
 
459 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.66 
 
 
346 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  25.51 
 
 
509 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30 
 
 
571 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>