25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0804 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0804  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3709  hypothetical protein  40.26 
 
 
312 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4255  hypothetical protein  39.23 
 
 
320 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0561  hypothetical protein  37.17 
 
 
320 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17370  hypothetical protein  36.7 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0639  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0932  hypothetical protein  31.49 
 
 
355 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141741  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  28.99 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  31.77 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  28.26 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2602  hypothetical protein  27.68 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  30.08 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  30.57 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  32.98 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.07 
 
 
286 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0019  hypothetical protein  27.33 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5388  hypothetical protein  30.34 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1580  protein of unknown function DUF559  30.14 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0898  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3715  hypothetical protein  36.94 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2561  hypothetical protein  27.93 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  27.99 
 
 
289 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  27.04 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2517  hypothetical protein  33.68 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  26.88 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>