More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0800 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
848 aa  1607    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  53.5 
 
 
845 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  45.49 
 
 
843 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  48.31 
 
 
834 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  45.07 
 
 
842 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  41.05 
 
 
847 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  38.68 
 
 
853 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  41.34 
 
 
849 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  41.18 
 
 
849 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  36.7 
 
 
852 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  38.98 
 
 
861 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  37.04 
 
 
873 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  33.63 
 
 
854 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  38.12 
 
 
853 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  37.92 
 
 
859 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  35.91 
 
 
856 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  40.43 
 
 
857 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  38.73 
 
 
873 aa  364  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  38.5 
 
 
806 aa  363  6e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  34.64 
 
 
855 aa  351  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  36.38 
 
 
836 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  38.08 
 
 
866 aa  336  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.71 
 
 
838 aa  333  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  36.21 
 
 
825 aa  312  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  37.74 
 
 
853 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 
861 aa  300  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  33.22 
 
 
821 aa  279  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 
839 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.68 
 
 
841 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.05 
 
 
855 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
801 aa  245  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.02 
 
 
828 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.28 
 
 
846 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.59 
 
 
880 aa  203  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  31.12 
 
 
871 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.08 
 
 
835 aa  194  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 
855 aa  194  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.77 
 
 
897 aa  185  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.05 
 
 
859 aa  180  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 
857 aa  174  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 
930 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
846 aa  165  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 
878 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.75 
 
 
863 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.86 
 
 
858 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.34 
 
 
854 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.57 
 
 
851 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
849 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.8 
 
 
855 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.77 
 
 
852 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 
849 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.84 
 
 
841 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.85 
 
 
850 aa  126  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.42 
 
 
856 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.04 
 
 
870 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.69 
 
 
858 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.31 
 
 
850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
828 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.9 
 
 
807 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.38 
 
 
857 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 
822 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 
847 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.11 
 
 
866 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.96 
 
 
849 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
884 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25 
 
 
858 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.66 
 
 
843 aa  99.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 
844 aa  99.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
822 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.95 
 
 
850 aa  89  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  37.18 
 
 
443 aa  89  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
847 aa  89  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.33 
 
 
452 aa  88.2  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
874 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20 
 
 
794 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.66 
 
 
413 aa  86.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
835 aa  85.9  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.36 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.23 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
839 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.06 
 
 
387 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.94 
 
 
396 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  29.3 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  21.99 
 
 
868 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.18 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  37.11 
 
 
650 aa  82  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  25.89 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.07 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  28.41 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  20.97 
 
 
684 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 
457 aa  80.5  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 
646 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
845 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30 
 
 
648 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30 
 
 
648 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  32.04 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.12 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>