More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0788 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  99.39 
 
 
330 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  99.09 
 
 
330 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  99.39 
 
 
330 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  100 
 
 
347 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  99.39 
 
 
330 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  51.93 
 
 
351 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  51.93 
 
 
351 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  51.19 
 
 
335 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  50.74 
 
 
335 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  50.74 
 
 
335 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  49.85 
 
 
335 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  49.09 
 
 
335 aa  275  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  48.52 
 
 
329 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  48.52 
 
 
329 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  48.52 
 
 
329 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  48.79 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  48.79 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  49.85 
 
 
329 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  49.1 
 
 
334 aa  266  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  48.65 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  46.93 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  46.93 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  46.93 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  46.93 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  47.59 
 
 
328 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  46.63 
 
 
333 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  47.12 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  48.53 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 
341 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  46.86 
 
 
341 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  48.88 
 
 
309 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  46.31 
 
 
332 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  46.31 
 
 
332 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  46.69 
 
 
328 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  46 
 
 
358 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  46.11 
 
 
358 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  46.11 
 
 
358 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  46.11 
 
 
358 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  46.11 
 
 
358 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  46.11 
 
 
481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  46.44 
 
 
318 aa  229  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  43.87 
 
 
318 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  43.87 
 
 
318 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  43.87 
 
 
318 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  41.28 
 
 
316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 
316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  41.28 
 
 
316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 
316 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  41.28 
 
 
316 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
315 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  39.82 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  40.37 
 
 
316 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  48.13 
 
 
422 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  37.16 
 
 
314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  37.16 
 
 
314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  37.16 
 
 
314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  37.16 
 
 
314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  37.16 
 
 
314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  37.31 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  37.38 
 
 
195 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  30.96 
 
 
597 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  32.8 
 
 
320 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  32.48 
 
 
320 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  32.48 
 
 
320 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  30.82 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  40.52 
 
 
208 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  29.97 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  29.97 
 
 
325 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  27.78 
 
 
327 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  27.78 
 
 
327 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  28.62 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.47 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>