208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0585 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
218 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  61.64 
 
 
219 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
218 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  61.36 
 
 
220 aa  206  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  61.19 
 
 
229 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 
222 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.57 
 
 
219 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.57 
 
 
219 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.57 
 
 
219 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.67 
 
 
211 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.91 
 
 
220 aa  188  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.16 
 
 
227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.01 
 
 
221 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.77 
 
 
216 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  62.21 
 
 
219 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  53.24 
 
 
216 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.86 
 
 
230 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 
213 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  43.4 
 
 
214 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  47.22 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.45 
 
 
230 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.24 
 
 
218 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 
212 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  44.29 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 
219 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.94 
 
 
219 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.25 
 
 
214 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  44.55 
 
 
221 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.62 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
218 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  42.41 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  39.07 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  40.57 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  45.71 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 
215 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  40.67 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
211 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.03 
 
 
212 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  29.03 
 
 
221 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  29.03 
 
 
221 aa  101  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
211 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
211 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.98 
 
 
211 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.72 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  38.76 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.38 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.11 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  29.36 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.53 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.84 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.44 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  27.44 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  27.44 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  26.98 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  31.22 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.6 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
429 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.18 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.17 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  41.07 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  26.58 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  24.76 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  24.3 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  29.69 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
298 aa  62  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.56 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.51 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  23.18 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  28.64 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  27.73 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  37.5 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.36 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 
429 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
417 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.7 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
430 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  24.68 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  25.24 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>