More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0580 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  100 
 
 
399 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  63.59 
 
 
386 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  62.28 
 
 
408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  61.68 
 
 
407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  60.66 
 
 
409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  59.29 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  55.86 
 
 
399 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  58.82 
 
 
385 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  60.26 
 
 
389 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  55.78 
 
 
399 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  59.9 
 
 
398 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  55.53 
 
 
399 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  55.53 
 
 
399 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  56.31 
 
 
403 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  51.39 
 
 
409 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0204  acetate kinase  58.44 
 
 
386 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  51.3 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  55.22 
 
 
378 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  52.54 
 
 
380 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  52.53 
 
 
402 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.99 
 
 
397 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  50.38 
 
 
403 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  50.38 
 
 
403 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  50.12 
 
 
401 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  48.63 
 
 
404 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  50.13 
 
 
422 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  49.25 
 
 
399 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  51.52 
 
 
394 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.1 
 
 
398 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  48.49 
 
 
401 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.87 
 
 
401 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47 
 
 
401 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  47.97 
 
 
396 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.73 
 
 
399 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  49.13 
 
 
402 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.73 
 
 
399 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  46.6 
 
 
398 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.61 
 
 
395 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  47.72 
 
 
396 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.12 
 
 
406 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.58 
 
 
394 aa  365  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  54.41 
 
 
395 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.62 
 
 
406 aa  365  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  48.11 
 
 
397 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.47 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  46.95 
 
 
396 aa  362  6e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.75 
 
 
398 aa  362  8e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.97 
 
 
397 aa  362  9e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  46.6 
 
 
398 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  48.38 
 
 
411 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  44.44 
 
 
398 aa  359  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  45.59 
 
 
398 aa  359  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  45.71 
 
 
396 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  55.93 
 
 
375 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  47.36 
 
 
408 aa  353  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  45.55 
 
 
397 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  46.06 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  45.52 
 
 
403 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  56.19 
 
 
371 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  44.05 
 
 
397 aa  351  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  46.48 
 
 
399 aa  350  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  46.06 
 
 
397 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  45.8 
 
 
397 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  46.73 
 
 
397 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  45.55 
 
 
397 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  45.55 
 
 
397 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  45.55 
 
 
397 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  46.1 
 
 
397 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  45.91 
 
 
402 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  45.29 
 
 
397 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  45.29 
 
 
397 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  46.73 
 
 
397 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.96 
 
 
414 aa  345  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  45.29 
 
 
397 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.97 
 
 
398 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  45.84 
 
 
398 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.84 
 
 
404 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  43.54 
 
 
399 aa  343  4e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  46.5 
 
 
421 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  45.54 
 
 
421 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  45.3 
 
 
421 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  44.8 
 
 
421 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  44.8 
 
 
421 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  50.12 
 
 
583 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  44.55 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.04 
 
 
404 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  43.8 
 
 
400 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  43.8 
 
 
400 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  45.05 
 
 
398 aa  338  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.17 
 
 
402 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  44.5 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  43.28 
 
 
417 aa  335  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  43.64 
 
 
399 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  45.27 
 
 
421 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  43.14 
 
 
399 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  43.53 
 
 
400 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>