More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0544 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  91.63 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  72.69 
 
 		 218 aa  322  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 249 aa  300  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.77 
 
 		 218 aa  294  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.56 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 215 aa  262  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.98 
 
 		 232 aa  257  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  62.44 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  59.24 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.29 
 
 		 216 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.96 
 
 		 213 aa  237  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.6 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.41 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.67 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 215 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  53.99 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.77 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  51.4 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.6 
 
 		 241 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  50.69 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  49.77 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  51.39 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.36 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  51.13 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.77 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  51.66 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.78 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  49.77 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.82 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.35 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.16 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  51.13 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.54 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.22 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.36 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  49.77 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.36 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 241 aa  187  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.67 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  47.03 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.66 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.44 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.66 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>