More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0519 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  100 
 
 
377 aa  762    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  58.89 
 
 
379 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  35.03 
 
 
382 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  35.31 
 
 
383 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  42.46 
 
 
375 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  34.54 
 
 
380 aa  236  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  30.92 
 
 
409 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  32.17 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  29.11 
 
 
373 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  30.86 
 
 
372 aa  169  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  30.95 
 
 
374 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  30.38 
 
 
374 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  30 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  29.55 
 
 
372 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
372 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  28.78 
 
 
376 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  34.57 
 
 
382 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.8 
 
 
377 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  30.25 
 
 
362 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  25.39 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  30.14 
 
 
386 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  31.39 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  30.41 
 
 
402 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 
400 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.86 
 
 
367 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  28.05 
 
 
396 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  29.37 
 
 
408 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  27.76 
 
 
396 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  25.7 
 
 
360 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 
388 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.33 
 
 
387 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
400 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  27.58 
 
 
397 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  29.39 
 
 
395 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  22.52 
 
 
375 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  30.5 
 
 
393 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  28.38 
 
 
403 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  29.94 
 
 
393 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  26.85 
 
 
385 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  23.18 
 
 
375 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  28.67 
 
 
368 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  28.52 
 
 
371 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  26.73 
 
 
393 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 
385 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  22.49 
 
 
375 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  28.38 
 
 
399 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
400 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  25.32 
 
 
387 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  23.36 
 
 
392 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  31.16 
 
 
399 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  22.99 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  23.89 
 
 
398 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  28.41 
 
 
396 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.65 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  26.64 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  26.73 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 
409 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  30.48 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  24.92 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  28.84 
 
 
395 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.4 
 
 
417 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  24.85 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  29.8 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  25.83 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  28.04 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  27.73 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.28 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  27.63 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  23.64 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  23.64 
 
 
395 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2062  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
374 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.928457  normal  0.422192 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  25 
 
 
399 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  26.06 
 
 
394 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.14 
 
 
399 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  24.92 
 
 
370 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  25.4 
 
 
387 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  27.69 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  26.92 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  29.9 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  23.32 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  23.32 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  23.32 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  23.32 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  23.32 
 
 
395 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  23.57 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  32.03 
 
 
400 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.21 
 
 
393 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  27.08 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  23.57 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>