50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0505 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
330 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.69 
 
 
329 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.57 
 
 
318 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.48 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.25 
 
 
325 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8646  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0643  hypothetical protein  28.94 
 
 
318 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  29.12 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  26.7 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  28 
 
 
208 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  25.77 
 
 
197 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  27.18 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  27.18 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  27.18 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  26.8 
 
 
197 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  30.16 
 
 
198 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  30.16 
 
 
198 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.06 
 
 
223 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.73 
 
 
202 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  26.63 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.86 
 
 
192 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
194 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.86 
 
 
192 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
194 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  27.84 
 
 
184 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.8 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  33.96 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.13 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  26.97 
 
 
189 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  25.97 
 
 
186 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  25.7 
 
 
186 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
192 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  25.28 
 
 
186 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.71 
 
 
188 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  24.72 
 
 
186 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  25 
 
 
188 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  26.56 
 
 
199 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  26.06 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  23.2 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
188 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.38 
 
 
198 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  23.78 
 
 
190 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.04 
 
 
205 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  31.82 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.62 
 
 
191 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>