More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0498 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  45 
 
 
1121 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  100 
 
 
1150 aa  2198    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  40.85 
 
 
1118 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  39.47 
 
 
1123 aa  569  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  40.23 
 
 
1123 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  35.9 
 
 
1090 aa  466  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  41.02 
 
 
1153 aa  413  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  34.78 
 
 
1114 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 
1036 aa  393  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33 
 
 
1132 aa  323  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.47 
 
 
1161 aa  300  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.66 
 
 
1071 aa  285  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  35.26 
 
 
1141 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  35.26 
 
 
1141 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  35.12 
 
 
1141 aa  244  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.84 
 
 
1148 aa  239  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.73 
 
 
1141 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.79 
 
 
1198 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  52.36 
 
 
489 aa  228  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.54 
 
 
1118 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  55.51 
 
 
655 aa  210  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 
969 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  53.66 
 
 
676 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.93 
 
 
723 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.08 
 
 
1000 aa  168  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  49.55 
 
 
611 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  35.68 
 
 
1029 aa  162  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  36.08 
 
 
1054 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.65 
 
 
1146 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 
1151 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  48.4 
 
 
628 aa  151  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  34.44 
 
 
1022 aa  149  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  41.37 
 
 
965 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 
1100 aa  146  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 
957 aa  142  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.61 
 
 
268 aa  141  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 
1005 aa  141  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.95 
 
 
1190 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.73 
 
 
1102 aa  140  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 
621 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.34 
 
 
1193 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  41.02 
 
 
1733 aa  137  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  36.08 
 
 
1103 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 
647 aa  136  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 
1022 aa  135  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  35.34 
 
 
1017 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.02 
 
 
1339 aa  134  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  38.74 
 
 
379 aa  134  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  37.76 
 
 
1088 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.67 
 
 
1092 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
973 aa  132  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.29 
 
 
1175 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.89 
 
 
931 aa  129  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  35.83 
 
 
388 aa  128  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 
981 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  37.7 
 
 
385 aa  127  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.05 
 
 
1029 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.84 
 
 
1186 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.41 
 
 
1125 aa  126  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.84 
 
 
943 aa  126  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  32.2 
 
 
654 aa  125  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.17 
 
 
926 aa  124  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  31.27 
 
 
1158 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  37.62 
 
 
1048 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.01 
 
 
1051 aa  122  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 
1097 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 
950 aa  121  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.93 
 
 
963 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.31 
 
 
1072 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.95 
 
 
989 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.14 
 
 
1110 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.62 
 
 
1034 aa  119  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 
996 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 
833 aa  118  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 
262 aa  117  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.05 
 
 
1071 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 
983 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  34.2 
 
 
597 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.37 
 
 
1422 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.5 
 
 
1291 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  39.3 
 
 
268 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.71 
 
 
1017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  38.67 
 
 
1055 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 
967 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.27 
 
 
1022 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.26 
 
 
919 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  35.4 
 
 
1036 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.9 
 
 
1003 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 
885 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 
990 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.25 
 
 
621 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 
992 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  29.53 
 
 
1108 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 
966 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.96 
 
 
1093 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 
937 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  36.39 
 
 
1021 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 
1058 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  28.76 
 
 
1030 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  33.64 
 
 
1025 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>