144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0465 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  50.11 
 
 		 1440 aa  1225    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  38.99 
 
 		 1339 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  100 
 
 		 1347 aa  2718    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  50.18 
 
 		 1363 aa  1208    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  36 
 
 		 1441 aa  688    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1365 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  38.99 
 
 		 1339 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1452 aa  831    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1461 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  41.16 
 
 		 1347 aa  879    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1366 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  53.76 
 
 		 1346 aa  1358    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  40.81 
 
 		 1409 aa  891    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1321 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1342 aa  506  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1353 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  38.49 
 
 		 846 aa  432  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  33 
 
 		 1290 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  33.37 
 
 		 1282 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  44.06 
 
 		 536 aa  389  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1243 aa  294  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1581 aa  164  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  28.28 
 
 		 978 aa  159  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  28.07 
 
 		 1432 aa  153  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  27.44 
 
 		 512 aa  148  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  29.37 
 
 		 918 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1022 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1375 aa  139  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  30.71 
 
 		 1343 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  28.79 
 
 		 925 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1151 aa  122  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1339 aa  122  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  29.91 
 
 		 1712 aa  121  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  31.37 
 
 		 1318 aa  120  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.34 
 
 		 1306 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1170 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1422 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1173 aa  118  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  27.45 
 
 		 1338 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  28.42 
 
 		 1358 aa  115  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  29.74 
 
 		 1322 aa  115  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1098 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1188 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1459 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1612 aa  113  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1338 aa  112  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  25.69 
 
 		 869 aa  110  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  28.5 
 
 		 1331 aa  109  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  27.75 
 
 		 1186 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1709 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1154 aa  105  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  28.15 
 
 		 973 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  40.61 
 
 		 1219 aa  104  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1349 aa  104  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  36.97 
 
 		 1354 aa  102  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1572 aa  102  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  26.45 
 
 		 1319 aa  101  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1332 aa  100  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  29.01 
 
 		 1321 aa  98.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  36.46 
 
 		 1355 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.36 
 
 		 1278 aa  97.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.08 
 
 		 1277 aa  97.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  30.17 
 
 		 430 aa  96.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  23.75 
 
 		 1159 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  36.63 
 
 		 1336 aa  94  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1557 aa  92.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1333 aa  92  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  36.36 
 
 		 1055 aa  90.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1184 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1426 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1751 aa  85.1  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1373 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1579 aa  81.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  26.44 
 
 		 1322 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  23.66 
 
 		 1640 aa  77.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.71 
 
 		 1257 aa  75.5  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.8 
 
 		 1573 aa  75.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1644 aa  75.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1184 aa  75.1  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.18 
 
 		 995 aa  75.1  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1642 aa  75.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1640 aa  74.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  20.71 
 
 		 1244 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  31.44 
 
 		 1442 aa  73.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  19.94 
 
 		 1250 aa  72.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  19.94 
 
 		 1250 aa  72.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  22.85 
 
 		 871 aa  71.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.48 
 
 		 1252 aa  71.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  32.16 
 
 		 1581 aa  69.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  22.85 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.37 
 
 		 1186 aa  67.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.32 
 
 		 1058 aa  67.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.27 
 
 		 838 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.18 
 
 		 926 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1575 aa  67.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.02 
 
 		 926 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  29.67 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2899  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  31.55 
 
 		 333 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  28.17 
 
 		 1020 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>