More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0416 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  57.14 
 
 		 199 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  50.53 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.61 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.56 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  40.62 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.52 
 
 		 199 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.75 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  42.19 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  42.71 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.53 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  44.27 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  39.06 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  41.71 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.58 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 		 202 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  41.49 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  39.06 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  39.06 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  39.06 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  39.06 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  39.06 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  39.06 
 
 		 242 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  39.06 
 
 		 242 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  40.11 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 349 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  38.34 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  40.62 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  38.54 
 
 		 691 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  36.6 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  36.6 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.36 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.9 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  41.15 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.15 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.67 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.18 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.12 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  41.92 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  41.15 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.74 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  37.63 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  40.72 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.31 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  36.6 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  40.93 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  29.38 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  39.19 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  36.82 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.75 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  36.08 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.15 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  29.38 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  40.1 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  40.1 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.93 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  39.58 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.78 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.06 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  36.98 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  38.02 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  37.11 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.08 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  40.62 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.93 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.81 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.43 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  37.63 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.43 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  38.5 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.9 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  34.55 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.08 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  37.24 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  31.55 
 
 		 329 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  41.97 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.38 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>