More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0408 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 388 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  58.78 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  58.51 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  58.51 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  62.79 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  51.2 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  52.83 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  54.5 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  49.6 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  54.76 
 
 		 395 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  55.41 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  55.73 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  53.43 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  55.15 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  52.3 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  48.91 
 
 		 393 aa  272  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  49.59 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  47.06 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  51.76 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  48.74 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  50.93 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  51.92 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.16 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.9 
 
 		 407 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  33.16 
 
 		 407 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.64 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.9 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.9 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.38 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.09 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  36.34 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.87 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.87 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.61 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  30.34 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31.41 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 		 747 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 757 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 664 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 586 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 745 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.49 
 
 		 587 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 741 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 586 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.07 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 666 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.81 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.81 
 
 		 587 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 		 587 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.08 
 
 		 720 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.46 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 567 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 		 662 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.52 
 
 		 585 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 782 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.57 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.17 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.57 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.57 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.59 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 		 585 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  29.3 
 
 		 649 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.59 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.29 
 
 		 375 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.3 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 649 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.01 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.01 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.01 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.01 
 
 		 585 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.3 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.3 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 710 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 657 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.3 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>