More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0317 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
343 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  52.1 
 
 
344 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  53.07 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  53.03 
 
 
303 aa  272  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  48.73 
 
 
381 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  39.94 
 
 
349 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
350 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  37.77 
 
 
360 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
356 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
639 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
347 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
347 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  39.17 
 
 
380 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  39.21 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
349 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
349 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
347 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
339 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  36.4 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
421 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
452 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
426 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
770 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.17 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.91 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
748 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.81 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.4 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.07 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.47 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.89 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  31.94 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.4 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
819 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
430 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  33.51 
 
 
411 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
389 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.03 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
816 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  30 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.45 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.03 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
827 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>