More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0231 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 420 aa  855    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  71.9 
 
 		 421 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 416 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  69.52 
 
 		 418 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  66.19 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 421 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 419 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 419 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  70.41 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  68.57 
 
 		 419 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 426 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 422 aa  541  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 426 aa  542  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  67.29 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  62.85 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 420 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 423 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  58.87 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  60 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 421 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 421 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 427 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 423 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 421 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 424 aa  308  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  308  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1382  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.760435  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 435 aa  302  7.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 428 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 437 aa  298  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5133  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358696  normal  0.0657107 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 420 aa  296  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>