More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0223 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  100 
 
 		 317 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  48.89 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  49.21 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  49.05 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  48.88 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  41.46 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  40.19 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  41.46 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  39.56 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.89 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  37.66 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  36.91 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  36.91 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  36.56 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  39.24 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  39.12 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  37.19 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  37.46 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.02 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  38.26 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.12 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  37.34 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  34.92 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  34.92 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  34.06 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  40.75 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  32.61 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  35.65 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.87 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  39.46 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  36.33 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  36.14 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.59 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.24 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  36.34 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.24 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.65 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  36.76 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.33 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.28 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  34.14 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  34.38 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.91 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.76 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.19 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  30.65 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.75 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  36.59 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.11 
 
 		 323 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  32.06 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.24 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.05 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.52 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  23.49 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.52 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.57 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.94 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.12 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.15 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.03 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>