More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0213 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  100 
 
 
109 aa  218  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  60.91 
 
 
115 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  55.56 
 
 
113 aa  127  4e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  57.43 
 
 
108 aa  125  2e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  54.13 
 
 
110 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  55.77 
 
 
107 aa  120  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  55.24 
 
 
110 aa  120  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  54.81 
 
 
110 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  60.19 
 
 
111 aa  119  1e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  60.71 
 
 
118 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  60.19 
 
 
111 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  56.19 
 
 
112 aa  116  1e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  54.81 
 
 
115 aa  112  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  54.9 
 
 
108 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  55.88 
 
 
107 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  51.96 
 
 
108 aa  108  2e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
113 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.98 
 
 
108 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  51.43 
 
 
107 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  56.07 
 
 
113 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  44.14 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  45.63 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  48.7 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  50.56 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  50.56 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  48.51 
 
 
113 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  7.73759e-05  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  45.19 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  49.5 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  48 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  2.45472e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  51.16 
 
 
138 aa  85.9  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  47.06 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
98 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  49.46 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  48.86 
 
 
125 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 
113 aa  82.4  2e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  48.24 
 
 
269 aa  82.8  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  9.17613e-09 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  47.92 
 
 
98 aa  81.6  3e-15  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
101 aa  81.3  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 
101 aa  80.5  7e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  40 
 
 
101 aa  80.5  8e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  35.11 
 
 
100 aa  80.5  8e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  50.62 
 
 
105 aa  80.5  8e-15  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
101 aa  79.3  1e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  44.83 
 
 
141 aa  79.7  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  40 
 
 
101 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  40 
 
 
101 aa  79.7  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 
141 aa  79.7  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  38.95 
 
 
101 aa  79  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  38.95 
 
 
101 aa  79  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  45.98 
 
 
142 aa  78.6  2e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  38.95 
 
 
101 aa  79  2e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  44.83 
 
 
141 aa  78.6  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  38.95 
 
 
101 aa  79  2e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  38.95 
 
 
101 aa  79  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.22 
 
 
127 aa  78.2  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
127 aa  77.8  4e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.75 
 
 
189 aa  78.2  4e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  45.33 
 
 
189 aa  77.4  6e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  9.44688e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
98 aa  77.4  6e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.22 
 
 
127 aa  77.4  6e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  42.31 
 
 
127 aa  77  9e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 
124 aa  76.3  1e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 
98 aa  76.6  1e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.75905e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
103 aa  76.3  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
137 aa  76.3  1e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  7.89559e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  48.19 
 
 
471 aa  76.6  1e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  45.78 
 
 
121 aa  75.5  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.62843e-08  hitchhiker  2.63083e-06 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
356 aa  75.5  2e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 
113 aa  75.9  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  45.74 
 
 
356 aa  75.5  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 
124 aa  75.5  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  43.68 
 
 
109 aa  75.1  3e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.46252e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.39 
 
 
170 aa  75.1  3e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.17 
 
 
142 aa  74.7  4e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
356 aa  74.3  5e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
127 aa  74.3  5e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
98 aa  73.9  6e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
220 aa  73.9  7e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.68 
 
 
383 aa  73.6  9e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  45.74 
 
 
356 aa  72.8  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.87 
 
 
566 aa  72.8  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  42.5 
 
 
547 aa  72.8  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 
103 aa  73.2  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
356 aa  73.2  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  44.32 
 
 
133 aa  72.4  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.37 
 
 
383 aa  72.8  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.87 
 
 
566 aa  72.8  2e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 
113 aa  72  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  41.1 
 
 
98 aa  72  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
277 aa  72  3e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>