More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0212 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2047  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  72.57 
 
 
467 aa  687    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.154966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  71.58 
 
 
472 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  71.03 
 
 
467 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0212  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
476 aa  960    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5306  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  82.18 
 
 
477 aa  770    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  72.07 
 
 
470 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  67.1 
 
 
471 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  66.67 
 
 
468 aa  634    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2448  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  67.97 
 
 
471 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3223  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  52.62 
 
 
463 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2476  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50.87 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1509  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  49.02 
 
 
469 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1462  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  49.35 
 
 
502 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0372006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1707  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  49.24 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  47.92 
 
 
501 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3303  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  47.61 
 
 
462 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00106265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.26 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4367  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4336  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4531  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  hitchhiker  0.00000533814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4454  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4457  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
470 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000163377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4024  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.257057  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  45.12 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.25 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483779  normal  0.676164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002152  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.63 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0102006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4078  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.25 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0137  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.25 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.647839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03847  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0805855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4024  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5422  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.349391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4502  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0108138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4196  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.91 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4447  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03796  hypothetical protein  44.13 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0623556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03582  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.03 
 
 
473 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4054  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.91 
 
 
466 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0478182 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00265  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.72 
 
 
476 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
466 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1719  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.79 
 
 
464 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0974339  normal  0.028819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2890  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.48 
 
 
471 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0118  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.29 
 
 
476 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0589234  normal  0.30721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.48 
 
 
465 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.48 
 
 
468 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14670  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  44.13 
 
 
464 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0194  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.73 
 
 
468 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3862  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.91 
 
 
464 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.73 
 
 
468 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.6 
 
 
468 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2370  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.89 
 
 
466 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0914  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  43.91 
 
 
470 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25390  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.96 
 
 
464 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.17 
 
 
464 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1603  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.83 
 
 
464 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.073582  normal  0.0278892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2151  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.61 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148708  decreased coverage  0.00883462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2106  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.83 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.61 
 
 
464 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1901  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.961651  decreased coverage  0.000428846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1668  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.61 
 
 
464 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.52 
 
 
463 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3591  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.61 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5091  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.18 
 
 
466 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1923  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.61 
 
 
463 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1333  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.77 
 
 
547 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201704  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1036  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  41.56 
 
 
547 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0951  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.55 
 
 
546 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000560958  hitchhiker  0.00448412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3894  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.3 
 
 
476 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3972  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.08 
 
 
476 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3831  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.08 
 
 
476 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.95 
 
 
481 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1805  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  42.92 
 
 
466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2516  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  40.22 
 
 
465 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
466 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.02 
 
 
471 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
472 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  33.98 
 
 
468 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 
470 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.42 
 
 
467 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 
468 aa  239  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
459 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
459 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
459 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
459 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 
459 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
470 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  34.04 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
480 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
471 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 
467 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 
467 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.83 
 
 
467 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.3 
 
 
467 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
459 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
477 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
467 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
459 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>