More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0204 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1387    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  47.52 
 
 		 726 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  47.04 
 
 		 710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  46.55 
 
 		 715 aa  514  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  44.68 
 
 		 730 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  47.68 
 
 		 709 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  47.68 
 
 		 709 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  47.68 
 
 		 709 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  34.32 
 
 		 762 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  38.48 
 
 		 817 aa  343  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  31.34 
 
 		 770 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  27.84 
 
 		 771 aa  333  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0566  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.74 
 
 		 674 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297383  normal  0.30294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.4 
 
 		 371 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1081  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.33 
 
 		 370 aa  173  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  27.04 
 
 		 679 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.84 
 
 		 387 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1006 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  25.4 
 
 		 989 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  28.45 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  25.08 
 
 		 968 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  28.36 
 
 		 380 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  26.54 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.22 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  24.34 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  27.32 
 
 		 369 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  31.23 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  31.29 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.96 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  30.63 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.27 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.77 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.84 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.29 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  26.64 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.11 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  21.71 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.93 
 
 		 267 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.64 
 
 		 378 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.78 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  24.86 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.93 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.65 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.87 
 
 		 249 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  28.47 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  28.17 
 
 		 369 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  31.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.58 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  30.9 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.2 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.76 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315425  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.13 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  30.4 
 
 		 380 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.58 
 
 		 684 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.36 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.25 
 
 		 398 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.22 
 
 		 232 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  30.07 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.94 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.64 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.56 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0600  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.51 
 
 		 214 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  25.52 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.12 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.87 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  24.72 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.26 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  28.32 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  31.76 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  30.38 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.87 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.03 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  19.79 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  28.57 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  23.51 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0614  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.61 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.22 
 
 		 255 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 267 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.91 
 
 		 236 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.76 
 
 		 268 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  31.45 
 
 		 346 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.92 
 
 		 282 aa  57.4  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.25 
 
 		 392 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.71 
 
 		 318 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.41 
 
 		 267 aa  56.2  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  27.95 
 
 		 381 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>