More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0144 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  79.19 
 
 		 149 aa  225  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  80.99 
 
 		 149 aa  225  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  78.17 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  76.39 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 		 170 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  39.84 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  35.48 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  36.75 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.66 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  36.11 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  42.17 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.85 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  41.11 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.54 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  40.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.95 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>