More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0135 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
400 aa  797    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  56.6 
 
 
403 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  47.69 
 
 
397 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  49.74 
 
 
398 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  46.45 
 
 
403 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  47.86 
 
 
408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  44.13 
 
 
467 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  47.47 
 
 
388 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  42.74 
 
 
351 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  45.61 
 
 
393 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  37.69 
 
 
400 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  37.44 
 
 
400 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  37.44 
 
 
400 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  39.73 
 
 
424 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  41.01 
 
 
399 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  34.89 
 
 
415 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  39.04 
 
 
400 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  38.98 
 
 
407 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  37.12 
 
 
402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.68 
 
 
423 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  36.52 
 
 
402 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 
404 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  39.25 
 
 
396 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  37.75 
 
 
371 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  33.17 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  36.27 
 
 
424 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  34.46 
 
 
372 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  38.46 
 
 
374 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  35.16 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  35.86 
 
 
387 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  32.74 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  38.02 
 
 
393 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  32.45 
 
 
388 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.81 
 
 
398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  32.53 
 
 
370 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  32.37 
 
 
394 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  30.42 
 
 
390 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.26 
 
 
377 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  32.41 
 
 
391 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  31.98 
 
 
389 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  32.87 
 
 
415 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  30.6 
 
 
384 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.68 
 
 
496 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
413 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.59 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
411 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.53 
 
 
388 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 
388 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  30.28 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.99 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
371 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.02 
 
 
381 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  25.87 
 
 
396 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 
434 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  29.62 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.01 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.15 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.23 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.15 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  28.18 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.33 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.21 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.22 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.71 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  24.3 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.78 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  25.71 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  22.88 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.93 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.35 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  27.35 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.73 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.19 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.38 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  20.5 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  24.92 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  24.62 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25.9 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.25 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.85 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.25 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  20.73 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.25 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.25 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.25 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>