More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0100 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  100 
 
 
335 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  56.93 
 
 
336 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  61.65 
 
 
329 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  58.54 
 
 
317 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  58.54 
 
 
317 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  58.54 
 
 
317 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  61.77 
 
 
351 aa  352  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  56.97 
 
 
321 aa  351  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  55.95 
 
 
329 aa  349  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  58.18 
 
 
319 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  54.87 
 
 
330 aa  345  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  55.19 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  54.31 
 
 
351 aa  332  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  51.17 
 
 
381 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  51.32 
 
 
343 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  50.15 
 
 
335 aa  285  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  50.75 
 
 
332 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  44.91 
 
 
324 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  48.8 
 
 
322 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  46.25 
 
 
348 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  45.28 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  47.51 
 
 
336 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  46.25 
 
 
319 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  42.44 
 
 
338 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  42.95 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  41.84 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  41.84 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  39.87 
 
 
313 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  39.07 
 
 
301 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  40.2 
 
 
301 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  40.66 
 
 
294 aa  202  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  38.33 
 
 
307 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  38.33 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  40.33 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  39.46 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  38 
 
 
307 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  38 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  38 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  38.21 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  36.67 
 
 
307 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  41.48 
 
 
307 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  40.84 
 
 
307 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  41.8 
 
 
307 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  39.11 
 
 
307 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  36.21 
 
 
307 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  39.11 
 
 
310 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  37.41 
 
 
313 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  41.76 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  38.95 
 
 
290 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
294 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  38.6 
 
 
307 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  41.89 
 
 
294 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  37.93 
 
 
318 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.61 
 
 
291 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  38.56 
 
 
307 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  42.07 
 
 
294 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.99 
 
 
296 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  39.22 
 
 
304 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  42.96 
 
 
293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  40.53 
 
 
301 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  41.76 
 
 
294 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  42.21 
 
 
309 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 
293 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  37.21 
 
 
291 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
293 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  41.91 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  39.53 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  41.06 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  37.83 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  42.44 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  37.83 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  41.76 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  41.76 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  39.56 
 
 
306 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  40.15 
 
 
301 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  40.46 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  40.74 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  36.75 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  40.88 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  37.78 
 
 
305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  42.15 
 
 
291 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  36.16 
 
 
307 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  37.04 
 
 
306 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  36.63 
 
 
311 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  37.27 
 
 
306 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  35.79 
 
 
311 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  38.01 
 
 
305 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  38.29 
 
 
314 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  40.73 
 
 
291 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  35.19 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  38.73 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  37.04 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  42.44 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  42.44 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  42.44 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  38.24 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  42.44 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>