140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0093 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 545 aa  1091    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.99 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.61 
 
 		 485 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 480 aa  107  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.94 
 
 		 456 aa  94.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 545 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 556 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.43 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 571 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 687 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 422 aa  87.4  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 634 aa  87  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 423 aa  86.7  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  26.53 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.99 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.99 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.46 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25.85 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  22.2 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.64 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.99 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  24 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  22.31 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.93 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  21.86 
 
 		 1123 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  22.16 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 628 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  23.25 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  21.96 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1492 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  21.99 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.18 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  34.95 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 241 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  22.61 
 
 		 462 aa  54.7  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 469 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 663 aa  54.7  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 235 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>