261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0090 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  48.29 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  46.38 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  45.19 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  44.24 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  46.57 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 191 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  43.27 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  39 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 189 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.96 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.78 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.08 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.36 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  34.23 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 150 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.9 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  34.16 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>