157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0076 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0076    100 
 
 
1146 bp  2272    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  88.68 
 
 
2025 bp  115  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  87 
 
 
1857 bp  95.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  85.19 
 
 
1923 bp  87.7  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  96.08 
 
 
1539 bp  85.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  87.21 
 
 
1476 bp  83.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  88.46 
 
 
1206 bp  83.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  84.07 
 
 
1572 bp  81.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  95.83 
 
 
1458 bp  79.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  94.12 
 
 
1323 bp  77.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  86.21 
 
 
1224 bp  77.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  94 
 
 
1170 bp  75.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  94 
 
 
1161 bp  75.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  92.45 
 
 
1305 bp  73.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  90.16 
 
 
1392 bp  73.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.65 
 
 
1506 bp  71.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.65 
 
 
1506 bp  71.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  93.75 
 
 
1536 bp  71.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.65 
 
 
1494 bp  71.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  90 
 
 
1515 bp  71.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  85.06 
 
 
1152 bp  69.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  93.62 
 
 
1197 bp  69.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  92.16 
 
 
1191 bp  69.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  89.83 
 
 
1086 bp  69.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  85.06 
 
 
1224 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  90.91 
 
 
1407 bp  69.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  92.16 
 
 
1323 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  93.62 
 
 
1416 bp  69.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  92.16 
 
 
1464 bp  69.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  92.16 
 
 
1323 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  85.06 
 
 
1140 bp  69.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  93.62 
 
 
1143 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  93.62 
 
 
1161 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  97.44 
 
 
1032 bp  69.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  92.16 
 
 
1416 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  92 
 
 
1752 bp  67.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  92 
 
 
1146 bp  67.9  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  85.9 
 
 
1206 bp  67.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  85.9 
 
 
1206 bp  67.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0016  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  92 
 
 
1206 bp  67.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  97.37 
 
 
1461 bp  67.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  84.04 
 
 
1578 bp  67.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  85.9 
 
 
1206 bp  67.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  92 
 
 
1392 bp  67.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  89.47 
 
 
1263 bp  65.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  95.12 
 
 
1227 bp  65.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  85.19 
 
 
1254 bp  65.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3867  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  95.12 
 
 
1302 bp  65.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  90.38 
 
 
1152 bp  63.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  91.67 
 
 
1671 bp  63.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  86.76 
 
 
1524 bp  63.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  100 
 
 
1383 bp  63.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  86.36 
 
 
1380 bp  63.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  89.29 
 
 
1254 bp  63.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  85 
 
 
1224 bp  63.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  91.67 
 
 
1845 bp  63.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  88.33 
 
 
1536 bp  63.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  97.14 
 
 
1209 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  90.2 
 
 
1614 bp  61.9  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  87.34 
 
 
1584 bp  61.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  90.2 
 
 
1158 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  91.49 
 
 
1170 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  94.87 
 
 
1128 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1057  hypothetical protein  83.91 
 
 
1365 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  83.91 
 
 
1140 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  89.09 
 
 
1548 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  90.2 
 
 
1416 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  94.87 
 
 
1425 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  94.87 
 
 
1131 bp  61.9  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  83.91 
 
 
1443 bp  61.9  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  91.49 
 
 
1215 bp  61.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  84.62 
 
 
1206 bp  60  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  84.62 
 
 
1164 bp  60  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  90 
 
 
1458 bp  60  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  84.62 
 
 
1206 bp  60  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  94.74 
 
 
1425 bp  60  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  85.71 
 
 
852 bp  60  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  97.06 
 
 
1371 bp  60  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  94.74 
 
 
1470 bp  60  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  90 
 
 
1557 bp  60  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  94.74 
 
 
1128 bp  60  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  85.71 
 
 
1638 bp  60  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  86.89 
 
 
1395 bp  58  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14920    88.68 
 
 
1008 bp  58  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0698754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  88.68 
 
 
1395 bp  58  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  92.68 
 
 
1272 bp  58  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  89.8 
 
 
2022 bp  58  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  87.5 
 
 
1635 bp  56  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  96.88 
 
 
1239 bp  56  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  89.58 
 
 
1638 bp  56  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  83.75 
 
 
1431 bp  56  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  88.46 
 
 
1164 bp  56  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  85.94 
 
 
1281 bp  56  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3121  PDZ/DHR/GLGF domain protein  92.5 
 
 
1080 bp  56  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  88.24 
 
 
1212 bp  54  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  88.24 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  88.24 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  88.24 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  88.24 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  88.24 
 
 
1209 bp  54  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>