284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0041 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 487 aa  996    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.19 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  32.66 
 
 		 494 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  32.11 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  31.6 
 
 		 556 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  32.31 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  32.31 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  31.12 
 
 		 492 aa  213  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  32.59 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  30.93 
 
 		 476 aa  192  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  28.07 
 
 		 649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  29.1 
 
 		 483 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.17 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  28.11 
 
 		 499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  29.22 
 
 		 532 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  30.88 
 
 		 631 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  28.65 
 
 		 636 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  28.65 
 
 		 636 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  28.73 
 
 		 578 aa  167  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1017  multicopper oxidase, type 2  28.05 
 
 		 716 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0884043  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 		 646 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2661  multicopper oxidase  27.27 
 
 		 703 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  25.76 
 
 		 688 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  27.45 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1253  Polyphenol oxidase protein  25.28 
 
 		 725 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  25.95 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  27.29 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2231  oxidoreductase  25.04 
 
 		 721 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.164894  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.99 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2141  multicopper oxidase type 3  25.32 
 
 		 721 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.209778  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  26 
 
 		 513 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  28.69 
 
 		 539 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  29.2 
 
 		 536 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  29.2 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 586 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  24.2 
 
 		 730 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 		 591 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.81 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  23.98 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.96 
 
 		 535 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.83 
 
 		 490 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  27.87 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  23.94 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  27.63 
 
 		 532 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.9 
 
 		 535 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  27.52 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  30.02 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  30.98 
 
 		 767 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  24.06 
 
 		 516 aa  114  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  28.33 
 
 		 538 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1337  putative multicopper oxidase  29.88 
 
 		 764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  24.54 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  24.54 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.11 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  26.67 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  26.82 
 
 		 321 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  30.67 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.33 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  25.05 
 
 		 534 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  25.05 
 
 		 534 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 529 aa  97.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  22.81 
 
 		 516 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  22.81 
 
 		 516 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  22.81 
 
 		 516 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  22.81 
 
 		 516 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.23 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  25.31 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  22.61 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  22.61 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  25.35 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  27.18 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  24.75 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  25.64 
 
 		 532 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  25.5 
 
 		 528 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.29 
 
 		 533 aa  93.6  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  26.22 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  23.59 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  24.1 
 
 		 569 aa  91.3  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 		 505 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  25.05 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  29.41 
 
 		 1087 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  20.89 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.91 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1384  putative multicopper oxidase-like  27.16 
 
 		 1459 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  22 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20801  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1485 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  23.6 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  30.67 
 
 		 1346 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.56 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39129  predicted protein  28.06 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.071399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  23.09 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  22.58 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>