33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0020 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1317    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  48.13 
 
 		 695 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  35.4 
 
 		 546 aa  138  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  30.62 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  31.47 
 
 		 573 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  30 
 
 		 559 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  30.16 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  31.13 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  29.08 
 
 		 569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  30.16 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  30.58 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  30.58 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  30.54 
 
 		 643 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  30.58 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  30.41 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  31.56 
 
 		 561 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  35.59 
 
 		 574 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  30.28 
 
 		 570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  33.91 
 
 		 567 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  31.68 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  31.34 
 
 		 545 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  30.25 
 
 		 573 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  28.61 
 
 		 629 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  27.72 
 
 		 587 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  30.28 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  28.39 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  27.54 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  30 
 
 		 564 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  27.73 
 
 		 627 aa  97.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  29.41 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  27.47 
 
 		 579 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  28.62 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  31.3 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>