53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0019 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  766    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  52.58 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  49.37 
 
 		 382 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  37.19 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  36.36 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  34.82 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  35.01 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  34.08 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  36.61 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  37.95 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  37.77 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  35.83 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  40.2 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  33.15 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  38.14 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  33.62 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  30.12 
 
 		 366 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  32.35 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  30.71 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  32.56 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  31.1 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  32.79 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  32.97 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  30.49 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  32.74 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  30.92 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  29.46 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  30.05 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  27.93 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  29.75 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  29.2 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  29.2 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  29.49 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  30.65 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.1 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  27.81 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  28.75 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  32.74 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  28.53 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  18.92 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  31.97 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  26.6 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  26.72 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  18.6 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  27.46 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  27.05 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  27.09 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  25.93 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  28.3 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  26.52 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  27.45 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>