More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0012 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0012  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2649  Triose-phosphate isomerase  56.45 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0889  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 279 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1917  Triose-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05908  conserved hypothetical protein similar to triosephosphate isomerase (Eurofung)  40.79 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3315  triosephosphate isomerase  40.39 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000244163  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  39.5 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  36.4 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  36.4 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  31.71 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  35.04 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  34.59 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  36.9 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  35.06 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  35.06 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  38.67 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  35.98 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  34.88 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  36.44 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  35.42 
 
 		 260 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  37.76 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  37.9 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  34.45 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  40.1 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  37.39 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  40.94 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  34.14 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  36.97 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  35.8 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  36.48 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  36.58 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  35.44 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  35.66 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  32.53 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  37.64 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  36 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  30.65 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  36.89 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  38.1 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  47.25 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  29.92 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  47.25 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  36.63 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  38.78 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  40.55 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  30.83 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.09 
 
 		 646 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  33.05 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.21 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  39.35 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  31.51 
 
 		 298 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  32.38 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  30.49 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  41.71 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  36.61 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  37.75 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  38.25 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  38.89 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  36.36 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  34.73 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  34.12 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  32.91 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  44.06 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  37.84 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.08 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  30.04 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  36.03 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  35.92 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  36.44 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  32.69 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  36.91 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  36.11 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  37.39 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  36.93 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  27.49 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  37.76 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  35.44 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  31.97 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  39.39 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  36.51 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.07 
 
 		 655 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  30.65 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  37.81 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  34.6 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  34.73 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  39.3 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  34.96 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>