More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0915 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 
162 aa  97.4  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  37.41 
 
 
146 aa  94  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
163 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
160 aa  89  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  31.69 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.73 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0852  signal peptidase II  35.86 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.213743  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  36.6 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.55 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
357 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  35.17 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.96 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.42 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  37.9 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  36.72 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.21 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  39.66 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.79 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  38.6 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  35.83 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  35.83 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.15 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  37.12 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  33.58 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>