73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0890 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.679116  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  28.47 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  28.47 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  26.32 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  26.67 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  26.72 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  26.47 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  24.58 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.72 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  27.5 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  24.58 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  24.58 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  24.79 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.7 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  26.85 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  27.34 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  25.74 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  23.64 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  23.73 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  23.73 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  23.77 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  23.77 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  24.11 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  23.64 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  25.66 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  23.39 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  28.36 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  23.58 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  24.07 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  26.39 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  23 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  22.93 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  23.15 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  23.21 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  27.63 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  23.01 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  27.63 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  23.01 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  23.01 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  21.43 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  23.89 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  18.12 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  29.52 
 
 		 607 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>