More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0717 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 550 aa  1124    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  52.72 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0981  tRNA modification GTPase TrmE  48.54 
 
 		 508 aa  302  8.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  52.04 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  48.6 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  46.84 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  46.03 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  45.7 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  45.7 
 
 		 428 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 		 428 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  44.97 
 
 		 428 aa  256  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  45.94 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  43.28 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  43.99 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  45.33 
 
 		 444 aa  246  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  46.2 
 
 		 437 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  46.15 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  45.03 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  43.12 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  44.63 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  46.03 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  45.85 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  42.81 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  44.48 
 
 		 419 aa  237  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  44.74 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 442 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3756  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043106 
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 442 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  41.61 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  42.43 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  41.1 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  40.73 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  41.86 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  44.85 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  44.74 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  42.22 
 
 		 441 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  41.83 
 
 		 460 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  41.37 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  40.59 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  40.07 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  44 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  40.4 
 
 		 456 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  41.35 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  44.7 
 
 		 441 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  45 
 
 		 445 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 456 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  40.57 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  39.6 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  39.6 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  39.31 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 		 449 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 		 456 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  41.86 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  39.61 
 
 		 437 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  38.78 
 
 		 455 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  40.46 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  39.94 
 
 		 518 aa  221  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  40.46 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 456 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  40.2 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  38.94 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4484  tRNA modification GTPase TrmE  39.6 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000179125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  39.4 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  40.26 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  39.34 
 
 		 452 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  37.54 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.39 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  217  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  40.13 
 
 		 460 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  39.02 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  39.94 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  38.41 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  44.3 
 
 		 459 aa  216  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  39.33 
 
 		 450 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002017  GTPase and tRNA-U34 5-formylation enzyme TrmE  38.14 
 
 		 453 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0189213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  39.14 
 
 		 454 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  43.23 
 
 		 437 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  45.98 
 
 		 456 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>