More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0687 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  56.26 
 
 
695 aa  799  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  55.84 
 
 
701 aa  792  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  54.89 
 
 
700 aa  772  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  54.52 
 
 
700 aa  780  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  54.69 
 
 
701 aa  770  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1351  elongation factor G  61.47 
 
 
691 aa  848  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.289583  normal  0.0183349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  54.01 
 
 
705 aa  768  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2446  elongation factor G  54.87 
 
 
703 aa  767  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47912e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  54.81 
 
 
700 aa  772  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  55.09 
 
 
700 aa  771  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  53.87 
 
 
705 aa  766  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  62.23 
 
 
691 aa  887  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2552  elongation factor G  54.73 
 
 
703 aa  766  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975271  hitchhiker  0.000776621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  54.95 
 
 
700 aa  775  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4693  elongation factor G  55.75 
 
 
698 aa  766  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.36363e-06  unclonable  6.46786e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  61.93 
 
 
691 aa  888  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  54.38 
 
 
700 aa  773  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  54.25 
 
 
723 aa  778  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  54.57 
 
 
690 aa  766  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4649  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.44499e-07  normal  0.01673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  55.25 
 
 
699 aa  783  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  58.14 
 
 
692 aa  828  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  57.08 
 
 
697 aa  819  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  54.51 
 
 
692 aa  787  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.15728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  55.27 
 
 
713 aa  788  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  53.57 
 
 
704 aa  770  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  54.35 
 
 
704 aa  784  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  61.44 
 
 
690 aa  880  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  54.38 
 
 
704 aa  776  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  55.06 
 
 
707 aa  785  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  58.71 
 
 
692 aa  847  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  55.24 
 
 
704 aa  787  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.62154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  54.81 
 
 
693 aa  782  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  62.23 
 
 
691 aa  889  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  55.1 
 
 
691 aa  782  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  52.95 
 
 
714 aa  771  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  53.72 
 
 
703 aa  771  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0273  elongation factor G  58.4 
 
 
705 aa  818  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  59.82 
 
 
698 aa  862  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  783  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  56.9 
 
 
699 aa  781  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  55.32 
 
 
701 aa  769  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  4.45234e-07 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  55.6 
 
 
699 aa  811  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  61.62 
 
 
691 aa  888  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  64.3 
 
 
691 aa  933  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  55.17 
 
 
691 aa  784  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.61111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  56.23 
 
 
692 aa  828  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  55.88 
 
 
691 aa  822  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  56.65 
 
 
702 aa  790  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  57.7 
 
 
691 aa  842  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  57.18 
 
 
697 aa  818  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  58.73 
 
 
698 aa  857  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  58.05 
 
 
701 aa  807  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  55.03 
 
 
698 aa  781  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  55.35 
 
 
704 aa  775  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  56.65 
 
 
702 aa  790  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  56.37 
 
 
689 aa  796  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  60.81 
 
 
692 aa  852  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  53.58 
 
 
706 aa  775  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  53.3 
 
 
714 aa  772  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  57.6 
 
 
689 aa  810  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  55.49 
 
 
692 aa  785  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  62.81 
 
 
691 aa  894  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  56.65 
 
 
702 aa  790  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  55.6 
 
 
699 aa  811  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  54.55 
 
 
701 aa  768  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20192e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  54.52 
 
 
700 aa  768  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  56.81 
 
 
700 aa  796  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  56.51 
 
 
702 aa  789  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  53.55 
 
 
705 aa  777  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  56.81 
 
 
692 aa  798  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  57.04 
 
 
695 aa  774  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  57.54 
 
 
706 aa  807  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  56.32 
 
 
699 aa  784  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.15857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  58.41 
 
 
701 aa  851  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  55.87 
 
 
699 aa  785  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  56.02 
 
 
689 aa  798  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  57.69 
 
 
690 aa  802  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  59.8 
 
 
698 aa  834  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  55.81 
 
 
689 aa  791  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  56.6 
 
 
691 aa  810  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.88442e-06  decreased coverage  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  56.04 
 
 
691 aa  808  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  57.04 
 
 
699 aa  833  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  56.25 
 
 
689 aa  803  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23880  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  54.89 
 
 
715 aa  788  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0292811  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  54.66 
 
 
690 aa  779  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  56.1 
 
 
700 aa  778  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  1.70843e-05  decreased coverage  8.39395e-11 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.37 
 
 
702 aa  842  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  57.53 
 
 
703 aa  827  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  56.17 
 
 
692 aa  824  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  58.14 
 
 
691 aa  822  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  54.86 
 
 
704 aa  788  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  58.5 
 
 
700 aa  833  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  59.42 
 
 
701 aa  857  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  58.78 
 
 
700 aa  858  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  58.99 
 
 
699 aa  863  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>