More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0477 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
604 aa  635  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
588 aa  1209  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  2.18693e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
600 aa  697  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
593 aa  683  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  5.54718e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
593 aa  661  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 
619 aa  697  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
606 aa  654  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
599 aa  652  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
595 aa  664  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
590 aa  702  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
590 aa  702  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
594 aa  634  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
607 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
597 aa  634  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
608 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  2.1993e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
605 aa  628  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  1.07292e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
591 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
608 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
591 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
591 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
591 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
591 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
604 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
605 aa  612  1e-174  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  4.63103e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
604 aa  615  1e-174  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
601 aa  614  1e-174  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
625 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
604 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
606 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
623 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
614 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
604 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
609 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
590 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
605 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
596 aa  590  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
594 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
595 aa  583  1e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
595 aa  584  1e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
595 aa  583  1e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
595 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
596 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
581 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  578  1e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
590 aa  575  1e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
590 aa  572  1e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
601 aa  573  1e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
590 aa  574  1e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
590 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
596 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
590 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
590 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
623 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
603 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
600 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
589 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.43263e-05  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
591 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
588 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  9.2939e-06  unclonable  3.39544e-08 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
592 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
598 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
594 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
594 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
594 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.45437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
589 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.7207e-05  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
592 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.9189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
598 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.00017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
598 aa  475  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  6.41857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
586 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.70105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
598 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
594 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.73748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
595 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
593 aa  475  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
590 aa  472  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
589 aa  471  1e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
582 aa  469  1e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
593 aa  469  1e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
593 aa  472  1e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
593 aa  469  1e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
597 aa  466  1e-130  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
594 aa  466  1e-130  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
591 aa  466  1e-130  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
600 aa  467  1e-130  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
593 aa  468  1e-130  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
597 aa  468  1e-130  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
591 aa  466  1e-130  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
591 aa  466  1e-130  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
602 aa  468  1e-130  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
590 aa  468  1e-130  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
600 aa  466  1e-130  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
585 aa  466  1e-130  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.43649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
592 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.91465e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
617 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
589 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
591 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
600 aa  462  1e-128  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>