277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0416 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  34.06 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  33.33 
 
 		 230 aa  132  9e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 217 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.46 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  27.35 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.39 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  26.03 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.05 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  28.83 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.36 
 
 		 238 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.27 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  26.41 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.85 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.8 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  26.78 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  30.53 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  25.91 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  25.66 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  27 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  26.78 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  26.67 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  27 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  25.19 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.14 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.91 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.14 
 
 		 234 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  27.23 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.13 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  25.4 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  26.13 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  26.13 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.68 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  27.51 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 220 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.78 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  24.58 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.89 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.18 
 
 		 232 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  25.53 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  26.32 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  26.75 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.55 
 
 		 215 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  24.14 
 
 		 230 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  25.43 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  24.69 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  26.87 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  24.14 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  26.75 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.8 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  25.93 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.76 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  24.14 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  22.37 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  23.42 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.74 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  28.16 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  26.64 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  25.53 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  28.15 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  27.85 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>