More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0396 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  51.67 
 
 
241 aa  259  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 
243 aa  257  1e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  49.59 
 
 
243 aa  251  5.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  46.53 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  47.93 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  42.17 
 
 
250 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  42 
 
 
249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  43.09 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  45.34 
 
 
260 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  43.15 
 
 
247 aa  187  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  44.53 
 
 
249 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  40.23 
 
 
258 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  40.49 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  42.34 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  40.49 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  40.24 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  40.24 
 
 
251 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  43.32 
 
 
250 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  43.78 
 
 
268 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  41.3 
 
 
250 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  42.11 
 
 
250 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  39.44 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 
249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  41.22 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  40.41 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  41.22 
 
 
250 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  37.96 
 
 
251 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  40.57 
 
 
248 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  38.28 
 
 
260 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  36.86 
 
 
261 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  38.06 
 
 
251 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  38.06 
 
 
251 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  38.55 
 
 
250 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  41.56 
 
 
282 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  38.06 
 
 
251 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  36.47 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  38.3 
 
 
251 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  39.63 
 
 
261 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  39.63 
 
 
247 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  39.17 
 
 
261 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  36.51 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  36.73 
 
 
267 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
249 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  37.89 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 
283 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.68 
 
 
229 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  31.69 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  31.2 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  34.9 
 
 
207 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  34.74 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.74 
 
 
229 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  33.74 
 
 
284 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  31.2 
 
 
285 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  32.75 
 
 
373 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  35.02 
 
 
373 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.16 
 
 
229 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.21 
 
 
230 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.65 
 
 
229 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  32.91 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  35.23 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  31.69 
 
 
341 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  30.57 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.3 
 
 
342 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  33.87 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  30.71 
 
 
267 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  29.46 
 
 
364 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  32.64 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  30.45 
 
 
266 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
278 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000324643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000188927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  32.74 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4023  F0F1 ATP synthase subunit A  31.28 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.040016  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  31.69 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4136  F0F1 ATP synthase subunit A  32.1 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000152507  hitchhiker  0.00113608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 
345 aa  91.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  28.76 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  31.14 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  28.14 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  30.97 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.66 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  31.82 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  32.62 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  30.36 
 
 
263 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5127  F0F1 ATP synthase subunit A  31.54 
 
 
289 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00619657  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  30.99 
 
 
264 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  30.17 
 
 
264 aa  88.6  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>