More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0290 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  100 
 
 		 117 aa  236  5e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0657  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0531891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0433  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  48 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  49.57 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  45.3 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  49.11 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 190 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  47.01 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 133 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  45.3 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  47.86 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>