More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0270 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0270  ribosomal protein S19  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  62.37 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  61.96 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  63.04 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 		 92 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 		 92 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  59.78 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  59.78 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  56.52 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  59.34 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0608  30S ribosomal protein S19  58.06 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0413  30S ribosomal protein S19  58.06 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  59.09 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  60.23 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  58.62 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  56.99 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  57.61 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  60.71 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  55.43 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_002978  WD0677  30S ribosomal protein S19  56.38 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.082813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  57.95 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  56.52 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  55.43 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  54.95 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  56.32 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  57.65 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  57.65 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  57.65 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  54.95 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  57.14 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  56.82 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  53.76 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  57.78 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  57.3 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  57.78 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  53.41 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  55.43 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  52.75 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  58.14 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  59.3 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  56.82 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  61.45 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  57.78 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  56.67 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  56.98 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>